Deep Flare: Explorer è un gioco di esplorazione spaziale 2D in pixel art con una trama elaborata. Il protagonista è il pilota di una nave stellare in missione esplorativa nel nostro sistema solare, e dovrà misurarsi con le difficoltà del viaggio spaziale: condizioni estreme, ambienti ostili, e soprattutto l’ignoto, con i suoi timori e le sue paure. In un’epoca dove la razza umana ha perso se stessa, il giocatore dovrà ritrovarla attraversando l’oscurità. Il gioco possiede inoltre elementi di crafting e shoot’em up, sebbene quest’ultimo sia secondario rispetto all’esplorazione.